596
215611226014562116
PŘEHLEDOVÝ3675207016974156235334409485586692777867
ČLÁNEK4580207016989163260360438521
Ces38387936014570127174
Urol40377936014578115180208
2021;42707936014562121178233249
25(1):45447936014562122153207231253
17–2648237936014561112166221279
logie,62489801312381142163216233
v881898013155
němž960898013164117206250
zásadní1234898013149100140190249307329
roli158789801313894117139
hraje175089801316495145167220
koncept1994898013152108167216266326359
diverzity237789801316587136188219266288322373
(blíže624104801312989113134178229
viz877104801315073117
tabulka1018104801313483143201223268319
2).136110480131548095
Lidský774119801314870127165209259
MM10561198013179162
je1241119801311970
dle1334119801315476127
dosavadních14841198013154111149198244292350406427473529
poznatků20361198013156113154211258289333390
z24491198013139
drtivé2511119801315484120141189239
většiny6241348013149100133174195251297
tvořen945134801312981138169220277
čtyřmi1245134801314581131163252274
hlavními1542134801315577125172230251339361
kmeny19261348013143133185243288
(z2238134801312568
celkových2330134801314495117161217265316363420
devíti,6241498013160113161184218240257
které906149801315087138169220
byly11511498013164111134182
v13571498013154
moči14351498013194152201223
popsány):16821498013164124184224274332378405421
Proteobacteria,2131149801315281134165209263318373418451495525546600619
Firmicutes,624164801314969100187209254309340384422441
Bacteroidetes10861648013160115161194238269323345400447479523561
a16671648013162
Actinobacteria1749164801316711214516722327833438943546851254356523131648013150
(8,2388164801313889108
9,2521164801316276
10,26221648013162110128
18)6241798013155103130
vlastní779179801316084134175211271294
data10981798013169120153204
autorů).13271798013160119153211244304330346
V16981798013166
souvislosti17891798013151111170221245285308368410445468
s22831798013150
urogeni‑23581798013168101159221276335358392
tálním624194801313485108166189279
systémem9281948013150100141176228319373464
bylo14161948013170118142201
dosud16421948013169128169226287
popsáno19541948013170130191232283342402
56223801948013163116167
růz‑25721948013141100145178
ných6242098013159105152210
bakteriálních8582098013158108154191242273296344366424445493551
druhů1433209801315789147205261
náležejících17192098013156105127180224275297319367389437494
do22372098013158116
2102377209801315198145
rodů2546209801313087147204
a6242248013151
představujících7002248013170103156218259294345394454478500550572622681
21,414062248013163112124178
%16092248013191
prokaryotické17252248013171104162210262294348406440463513559612
diverzity2362224801317093143197229277301335388
lidského624239801312345104143188240298356
organismu.1004239801316193151199257279318406463482
Celkem15102398013165116138183235324
35018582398013156105157
(62,32039239801313181132149203
%)22662398013183108
z23982398013147
těchto2469239801313586136193225281
5626242548013154108159
druhů8082548013169101160219277
se11102548013150104
vyskytuje12392548013159112153199252290349372426
i16902548013131
jako1746254801313282128186
součást19572548013150109168218268309344
střevního2326254801315086118170220280303364424
mikrobiomu6242698013190112157190247307330388477534
(18).1182269801313077123150165
MM7742848013185170
se969284801313892
liší108628480131204282104
u12152848013155
obou12952848013155116176234
pohlaví15542848013158117177200249297321
druhovou1899284801315789148206265314371430
skladbou2354284801313883108158218278337396
a6242998013150
zastoupením698299801314193133168224283343397455478567
rodů1289299801313087147205
z15182998013141
hlediska1584299801315679132193215255300351
relativní1960299801312981105154186209259318340
abundan‑23252998013147107165224283333391425
ce.6243148013149101119
Velmi7683148013159110134223246
často10393148013152103144179237
dominuje13013148013163122213236294352376429
mikrobiomu17553148013194117163197255316340399490548
pouze23283148013164124183228281
je‑2634314801312781116
den6243298013160113172
rod,821329801313087149168
který1014329801314381133165218
představuje1257329801315891143204244280330379438461515
většinu1797329801314799133176198256314
detekovaných21363298013157111145197244301350401460507555614
sekvencí;624344801314196143197250309359382400
analogicky10503448013159118168192251313336386432485
ke15613448013155109
střevnímu1695344801315086119172222282305396454
mikrobiomu,21753448013199122169203261323347406497556575
kde6243598013147106160
se8093598013145100
hovoří9343598013163123172230263286
o12463598013162
enterotypech,13343598013157116149201234291325377439494545604623
se19823598013146100
u21073598013163
MM21953598013190176
používá23963598013165125184229253303354
výraz6243748013150103137188234
urotyp8843748013167100158192244306
(1).1216374801313887108125
U13663748013178
6014703748013163118
%16133748013191
žen17293748013154106166
dominuje19203748013169129220243302360383437
MM23833748013195181
rod25893748013142100161
Lactobacillus,6243898013146102149183238295352399421444467524561582
u12313898013169
2213263898013164118
%14703898013192
rod15873898013143101164
Gardnerella17863898013166122155209266314346392416439495
a23063898013160
u23923898013169
ostat‑24873898013168110147198232263
ních624404801315981129187
se836404801313892
vyskytuje952404801314799141186238276334357410
směs13874048013138126180220
různých1632404801313088132192238286344
druhů2001404801315788147205263
bez22884048013158112157
zjevné2470404801314165118167227280
dominance6244198013161122215239300351412463517
jednoho1167419801313389152213274335396
z15904198013154
nich1671419801316993144205
(19,1902419801313989137153
20).20814198013165119148165
Biologický2273419801316690151176237300324375423477
význam6244348013151105155216268360
ani10104348013161121145
potenciální11814348013172134169222283334358409433494517
klinický1725434801315783107167191242289344
dopad20954348013171131195247310
tohoto24314348013144103164225260319
fenoménu624449801312981139198287341399456
není11054498013156109167190
zatím1319449801314192125148237
zřejmý1580449801314174126148237283
(14).1888449801312674121147163
Další20754498013168117140179201
rody,2301449801312986146195209
které2534449801314481132164216
bývají6244648013161109163214238260
v9094648013151
ženském986464801314598157197243296386
MM13974648013187173
běžně15954648013162117162222276
detekovatelné,18964648013161115149201248306355406439491515574628646
jsou2567464801312565124183
(metodikou6244798013129117172206264326349396454514
EQUC11634798013161135205269
prokázané)14574798013170104162210262308360420474503
Corynebacterium,19944798013160113145194251299355411458492537569592648735755
Streptococcus,624494801314979112158215247302349403451496552589610
Actinomyces12564948013167114149172229285375419465511550
a18314948013160
Staphylococcus1927494801314979133190249293316372420474522567623660
(8).2612494801313992121137
EQUC6245098013151125194257
je906509801312680
schopna1011509801314393152211272332382
odhalit14185098013161122181231254277311
6617545098013156111
%18915098013183
bakteriální19995098013163114160198250283306356379438460
abun‑24855098013152112172231265
dance6245248013161112172223276
zdravého9265248013155116149201251305366427
ženského13795248013154108168210257311372432
MM.18385248013196184205
Zbylé20695248013170132182207262
mikroor‑235752480131101125172208267328362393
ganismy6245398013160110169191231321368
detekovatelné10185398013161115149201248306355406440492515574628
pomocí16715398013163123214273324347
NGS20435398013172141192
představují2260539801316395148209250285336385444467490
anaerobní6245548013150109159213245303364424447
rody1096554801313996158207
Propionimicrobium,1334554801315283136193216271328350437460505537590646669725812832
Varibaculum,21865548013160112143166221277323378401457544563
Atopobium297689801316092146204261318342398487
z3489898013155
kmene3570898013156150206266321
Actinobacteria;3927898013160107141164222278335393440474520553576632651
Peptoniphilus,45998980131611071641962513093323894474702976104801312378115135
Megasphaera,31321048013190138193249286340397452499531583603
Finegoldia3756104801315677134181236292315370393448
z42301048013153
kmene43091048013155147202261315
Firmicutes;4658104801314870101188211256312343388426444
a29761198013156
Prevotella3054119801316192139187243275321345368425
z35061198013154
kmene35861198013157151207268323
Bacteroidetes39451198013154111158193239272327351408456489535575
(21).4546119801313993142164181
Mužský47531198013197157203248296350
mikrobiom29761348013189111156190246306329387476
je3476134801312073
dosud35731348013156114154211270
méně38671348013186139197250
podrobně41411348013157116176208264324383436
popsán46011348013157116176216266324
než49491348013155108153
ženský.2976149801314597157198244297312
Jako3314149801314797144202
dominantní35421498013169129220243303353412445505528
rod40961498013142100162
se42831498013150105
zpravidla44141498013153115149200249274334358408
uvádí48471498013168119171232255
Staphylococcus,2976164801314878131187244287310365412465512556611647667
Streptococcus3664164801314979110155211243297343396443487542579
a42681648013151
případně4344164801316194117178229290349402
Corynebacterium4772164801315911214419324929629761798013155111157191235267289344431
(20,3432179801312679131149
22),36061798013151105132148
dle3779179801315780134
našich39381798013156105146168217276
vlastních4239179801314771120161196255278327385
dat46491798013157107140
se4814179801313892
kro‑4931179801314478135171
mě29761948013190144
nich3145194801316183133192
(a3362194801313077
v34641948013151
našem35401948013161110151205295
souboru38601948013143102161222282315374
častěji)42601948013150100141177229252275303
vyskytovala45881948013151105146192245283341390441464514
Pseudomonas2976209801315290136192247302390445503558595
a35962098013151
Prevotella.367420980131528312817522926130632835140640782098013119
Stabilita3126224801315182132191214236257291340
MM34902248013183168
v36822248013147
čase3753224801314796136189
je3966224801312174
jednou4064224801312173133191250307
z43962248013141
důležitých44612248013158114136189233256289340388446
otá‑4931224801315688138171
zek,2976239801314496142163
na31632398013155104
které3291239801314380131163214
se3529239801313891
bude36442398013157115175228
muset38962398013187144183236269
zaměřit4189239801314192181234264287320
další45332398013156105127166187
výzkum.4745239801314698145191249338357
Data29762548013173123157208
z32092548013154
HMP32882548013180167223
naznačují,35362548013169120166227277327386409432451
že40122548013154107
mikrobiomy414425480131101124171206264326350410502550
jednotli‑4719254801313387149209269303326349383
vých29762698013151105154213
lokalizací3214269801313392140192216238283336386409
v36482698013159
organismu37322698013169102162212272294335426485
jsou4242269801313273133192
v44602698013159
čase45442698013159110151206
stabilní4775269801315086137199222245304327
(4).2976284801313081107123
Vzhledem31242848013165110170193248309364455
k36042848013156
fyziologickým3685284801313791139163222246306367390440486539632
změnám43422848013153145200259309400
(včetně4767284801313886135187221281335
hormonálních)29762998013160120153245305365415438497520569628654
v36552998013160
procesu37402998013170103161212264306364
stárnutí4129299801315085136169229288322345
se44992998013151105
však46292998013159101152199
vývoj48532998013159112167226249
MM29763148013186170
dá31703148013163112
předpokládat,3306314801316495147207267326372396445504553585604
byť39343148013164111149
dosavadní41073148013163121161212259309368426448
poznatky45793148013164123165224273305350402
se5005314801314497
v29763298013149
tomto3049329801312984173204259
ohledu33313298013154112133185244301
rozcházejí3655329801312884125171228276320370391413
(23,4091329801312575127143
24).4258329801314996120135
Dle4417329801316689141
jedné4581329801311971130187239
studie4844329801313670127185206258
se2976344801314092
např.30913448013153100158188199
rody3313344801312782141187
Jonquetella,3519344801313790144197250294324366387407460478
Parvimonas,4016344801314797126174194278330385437472490
Proteiniphilum4525344801314876127156198219273293346400420440493577
a29763598013150
Saccharofermentans30573598013148102147190245299330383410454485571617673703754810845
vyskytovaly39263598013156108149194246283339387437459507
u44573598013165
obou45463598013165126185243
pohla‑48133598013167126185207256289
ví2976374801315073
výhradně30743748013158111171202253313372425
ve35243748013158111
věkové36593748013159111157214263316
skupině3999374801315096154215238296349
70+43733748013162113179
(23),4577374801313789143168184
což47863748013157114157
ale4968374801315881134
např.29763898013159108167199211
naše32113898013159107147200
vlastní3435389801315073121161196254276
data37353898013159108140190
nepotvrzují.39493898013159112172231263316348395453475497515
Vůbec31264048013157114175231281
první34324048013171104158218241
studií,3698404801315086145206229251270
která3993404801315593146178229
nabourala42474048013169119180241300333384407457
postulát47294048013170131172208267290340373
o29764198013159
sterilitě3059419801314984136167190212234268319
zdravé34024198013153111143193241293
moči,37194198013199158207229247
byla39904198013169117140189
práce42044198013169101151200252
Siddiqui4480419801315981140200222281339361
et4865419801316295
al.,4984419801315981100118
kteří2976434801314886139172196
v31974348013160
moči328243480131101162213236
osmi35444348013168110202225
žen37944348013155108168
s39884348013150
negativním40644348013169124187238271295346407430522
výsledkem46124348013159113156179234297344398490
standardní2976449801314176125183242291322380438460
kultivace34604498013153111133166188238287336387
detekovali38714498013167119153204249306354404426448
a43434498013157
metodou44244498013196150183239299357415
pyro‑48634498013168115147204239
sekvenování2976464801314194139192243301359407457514536
(původní3536464801312585143192248308366387
technika3947464801313081131188245267312363
NGS43334648013167135184
před4541464801315789140200
zavede‑4765464801314091138190250302337
nímmasivního2976479801315879165273320359379427484505564620
paralelního36194798013156104135183204256277333354412469
sekvenování)4111479801313688132183234290347394442498519552
dešifrovali46864798013154106145165192224279326374395416
bakteriální29764948013161111156193244275298346368426447
16S34484948013160107155
rDNA.36274948013140110180243264
Nejvíce39154948013177130152201224272323
zastoupené42624948013151102142176232290350404462515
kmeny48014948013153144197255301
byly29765098013160107130177
kromě3177509801314275131219272
čtyř3473509801314480130162
výše3659509801314597137189
uvedených38725098013154102154213265323368415472
ještě4368509801311971111144195
Fusobacteria4583509801314899134187241295340372415445466520
a29765248013151
nejčastějšími30515248013168123145194245285321372395435457547569
rody3645524801314199160210
byly38795248013170118142191
Lactobacillus,41045248013146101146180233289345391413435457512548568
Prevotella4692524801316090134181235267311334356411
a29765398013150
Gardnerella30505398013165120150202258303334378400421475
(3).3549539801312980105120
Další36935398013171120142180202
prvenství,3919539801316193146197255295329381404422
tentokrát4365539801313485143175231277310360392
pro4782539801316092149
de‑49555398013160112147
tekci2976554801313587133182204
MM32055548013195182
metodou341155480131100155188246307367426
EQUC,38625548013160134204267286
patří41735548013170121154186210
týmu4407554801314396188246
Hilt46785548013179101124158
et4861554801316296
al.,4982554801315982101120
Tab.6245865013760111177205
2.851586501375989
Koncept9955871013152104160205249304334
diverzity1349587101315375120165195239261291338
a17075871013154
další17815871013153107129164184
vybrané1985587101314492147177229284330
pojmy23355871013153108129216258
používané26135871013154109164206227272325381427
v30595871013145
popisu31245871013153108163185220273
mikrobiomu34175871013186107151182235290312366452507
(38).3944587101312775124150165
OTU41295871013169113179
–43285871013153
operační44015871013153108155185236281336357
taxonomická47785871013130821271802362906246021013187109153197250
jednotka,894602101312268122178232263306360378
blíže129260210131567799141185
viz1497602101314667109
text1626602101313276122155
Tab.6246165013760111177205
2.851616501376191
The9976171013149105151
notion11686171013156111141162217273
of1461617101315482
diversity1562617101315677123167198235255285333
and19146171013156111166
other2099617101315586141187218
selected2336617101313883105151196228272327
terms2683617101313275106192227
explained2930617101314793147169223245300346401
(38).3350617101313077126153167
OTU35376171013171115181
–37386171013155
operational38136171013155110156187238269290344400454476
taxonomic4308617101313284129182238293379400445
unit,47736171013155111132163181
see4974617101313883129
text624632101313276122155
for799632101312882113
details9316321013156102133185206227262
diverzita665648501105276122168201243267299346
rozmanitost1231648801072774109183224272291319365399428
zastoupení1679648801073678111140187235285330378396
mikroorganismů2095648801077492130158205254281329370418437469543590
ve2705648801074084
vzorku2808648801074180127154192241
alfa-diverzita123165880107416084126154205224265308335373392420462
=17136588010753
rozmanitost1786658801072774110184225273291319366399428
druhů2234658801074976124172220
v24736588010741
rámci2534658801072769142183201
vzorku2755658801074180127154192241
(měřítkem3015658801072596140166185213251294367
alfa-diverzity340265880107416084126154205224265308335373393421463
jsou3885658801072052101149
např.4054658801074889139165176
Chao42496588010752100141189
index4458658801071967116160200
a46786588010741
dále4739658801074990108152
také4911658801072870108151
Simpsonův1231668801074260133183216265313361402
a16526688010743
Shannonův1715668801074391132180228276325372413
index,2148668801072068117162201218
které2386668801074070113139182
berou2588668801075296123170218
v28266688010742
potaz28886688010751101128169207
druhovou3114668801075177126174222262310358
bohatost34926688010751100149190217264297326
(richness)383866880107254969109157205249283316337
i41956688010720
druhovou4235668801075177126174222262310358
vyrovnanost4613668801074285113160200249290338386420449
(evenness))1231678801072465106149197245289323356378399
beta-diverzita1231688801075095124165194246265306350376415435463505
=17566888010761
rozdíly1837688801073381116165184205246
v21036888010747
zastoupení2170688801074386120149196245295340389407
mikroorganismů25976888010781100138167214264291340381429448481555603
mezi32206888010781125163183
více3423688801074767107150
vzorky3593688801074887134162201244
(měřítkem38576888010731102147173192221259303377
beta-diverzity42546888010757102130172201252271313357383422442470513
je4787688801072671
např.4878688801075596146173184
Bray-Curtisův1231698801074572114153180234280307338357389436477
index1728698801071967116160200
nebo1947698801074993143192
Sørensenův2158698801074291118161209242286334382423
index)2600698801071967116160200224
abundance665713201104699151203256302354395441
počet1231713501075099140182210
jedinců1461713501072064114133181221269
ve1750713501074285
vzorku;1855713501074281128155193241256
relativní213171350107287190130158176217267285
abundance2436713501074292140188237278326367409
=28657135010755
poměr29407135010751100174218244
počtu32047135010751100142172220
jedinců3443713501072165115134181222270
dané3732713501075191139184
OTU39357135010762103160
k41157135010740
celkovému4174713501074284104141188229272346393
počtu45877135010751100141171219
mikro‑4826713501077594132160207236
organismů1231723501074875123164212230263336384
ve1634723501074184
vzorku1738723501074179126153192240
richness66573800110325696148200247285323
bohatost1231738301075099148188215262296325
–15757383010745
celkový1640738301074083102139187227270
počet1930738301075099140182210
odlišných2160738301074798116135167215254294342
OTU25217383010761101159
ve2700738301074083
vzorku2803738301074180127154192240
(záleží3063738301072461103122166203222
na3305738301074889
hloubce3413738301074867116164213255297
sekvenování)3730738301073377116159203251299340381429448476
evenness665752701104692138190242289327365
vyrovnanost1231753001074184111158199248288336385418447
–16987530010747
rovnoměrnost1765753001072875116165213287331358406455488517
zastoupení2302753001073880114143189238287332380399
OTU27207530010763103161
ve2901753001074285
vzorku;3006753001074381129155194242257
dokonalá3283753001075099137185233274293333
vyrovnanost3636753001074386113160201250290339387420449
nastává,4105753001075091124153195234276292
pokud44167530010752101140188237
každá4673753001074082120168208
OTU49017530010762103161
(nebo1231763001072470114163213
obecně1463763001074898143184233277
každá1759763001073881118166207
kategorie)1985763001073881108150200249276295339360
ve2365763001074184
vzorku2469763001074079126153192240
má27297630010773114
stejný2863763001073362105124172210
počet3093763001074999140182210
členů3322763001074159103151199